Вчені з ПАР з’ясували, що ПЛР-тест при штамі Омікрон найбільш ефективний, якщо мазок брати зі слини, а не з носоглотки. Крім того, цей штам проявляється раніше і починає розповсюджуватися ще до того, як може бути виявлений.
Про це повідомив колектив вчених у статті, розміщеній у medRxiv.
Дослідження вчених Кейптаунського університету, Діагностичної вірусологічної лабораторії Green Point, Національної лабораторної служби охорони здоров’я Кейптауна говорять, що при штамі “Омікрон” у 14% випадків мазок з носоглотки давав негативний результат при тому, що коронавірус в організмі був. Для порівняння, при штамі “Дельта” найбільшу ефективність давав саме мазок із носоглотки. У порівнянні з пробами зі слини він був ефективнішим на 29%.
Вчені вважають, що лікарям доведеться змінювати алгоритми тестування, пристосовуючи їх до особливостей південноафриканського варіанта, оскільки поточні стандарти не підходять для Омікрона.
В рамках дослідження для оцінки діагностичної ефективності різних типів зразків вчені набрали 382 пацієнти з гострими симптомами, не госпіталізованих, які звернулися для тестування на SARS-CoV-2 у період з серпня по грудень 2021 року в лікарні Groote Schuur (Кейптаун). Були зібрані та протестовані мазки із середньої носової раковини та слини.
“Ці результати свідчать про те, що характер виділення вірусу в ході інфекції змінений для “Омікрон” з більш високим виділенням вірусу в слині в порівнянні з назальними зразками, що призводить до поліпшення діагностичних характеристик мазків слини. Це важливий висновок, оскільки поточний стандарт діагностики з використанням мазків слизової оболонки носа або носоглотки може бути неоптимальним для штаму “Омікрон”, – вважають вчені.
Інше дослідження, яке проводилося США, підтверджує дані південноафриканських учених.
У грудні 2021 року американські вчені проводили дослідження серед випадків COVID-19, виявлених на робочому місці. Дослідження показало, що середній час від першого позитивного результату ПЛР до першого позитивного антигену, що визначається, становило 3 дні. Після виявлення інфекції підгрупа показала пік вірусного навантаження у слині за 1-2 дні до назальних тестів. У всіх людей симптоми розвинулися протягом двох днів після першого позитивного тесту ПЛР.
Виявилося, що експрес-тести на антигени відставали у здатності виявляти COVID-19 в ранній період захворювання, коли більшість людей були інфіковані “Омікроном”, і було підтверджено кілька випадків передачі. Таким чином, швидкі тести на антигени можуть бути не такими, що підходять для скринінгу для запобігання безсимптомному поширенню “Омікрону” в порівнянні з попередніми штамами, враховуючи більш короткий час від контакту до заразності і нижчі інфекційні дози, достатні для передачі.
Джерело
